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早期胚胎發育是生命科學領域的核心研究方向之一。胚胎從受精卵開始發育,經過基因組激活(zygotic genome activation, ZGA)、快速細胞分裂和譜系分化,最終形成囊胚,為胚胎着床及後續發育奠定基礎。在這一過程中,囊胚内三譜系的形成——内細胞團(inner cell mass, ICM)、原始内胚層(primitive endoderm, PrE)和滋養外胚層(trophectoderm, TE)——标志着胚胎命運決定的關鍵轉折點。然而,受限于胚胎樣本的稀缺性和實驗條件的限制,如何構建精準模拟早期胚胎發育的體外系統,仍是該領域亟待解決的科學難題。
2021年,北京大學杜鵬教授課題組通過抑制剪接體,首次捕獲并穩定培養了小鼠全能性幹細胞(mouse totipotent blastomere-like cells, mTBLCs)(Shen et al., 2021)。與經典的多能性幹細胞不同,mTBLCs能夠重現全能性卵裂球的特征,為構建從單細胞開始的分化和囊胚形成模型提供了理想的“種子細胞”。 随後,在2024年,研究團隊利用相同的策略成功獲得了人的全能性幹細胞(Li et al., 2024),為進一步探索全能性及其在胚胎發育研究中的應用提供了重要工具。
基于mTBLCs的這一特性,2025年1月17日,杜鵬課題組在Cell Stem Cell雜志在線發表了題為“Mouse totipotent blastomere-like cells model embryogenesis from zygotic genome activation to post implantation”的研究論文。在這項研究中,作者進一步優化了mTBLCs培養條件,并開發了mTBLCs自發分化和單細胞起始的類囊胚形成系統,mTBLCs-類囊胚具有EPI、PrE和TE譜系,并能進一步形成着床後階段的卵圓柱胚樣結構,重現了從ZGA至囊胚形成的完整發育過程。這一突破為研究全能性、細胞命運決定以及早期胚胎形态發生提供了新的技術平台,也為早期發育的基礎與轉化研究開辟了新的可能性。
論文截圖
圖1. 通過mTBLCs模拟小鼠早期胚胎發育的關鍵事件的模式圖
在本研究工作中,作者主要有以下發現:
1:該研究通過優化培養基(2MYCP),顯著提高了mTBLCs的增殖速度和長期自我更新能力,主要通過加入2-DG、Minocycline、Y-27632、CHIR-99021和PlaB等因子。在此過程中,PlaB發揮了關鍵作用,通過抑制剪接驅動了從多能性向全能性的轉變,而Oct4基因的去除并未影響mTBLCs在2MYCP培養基中的自我更新能力,表明Oct4不是維持細胞全能性的必要條件。2MYCP培養基中,Wnt信号通路在mTBLCs中被激活,且Wnt信号通路與細胞周期、增殖通路的激活與mTBLCs的快速自我更新能力密切相關。進一步的實驗結果表明,抑制Wnt信号通路可顯著抑制mTBLCs的增殖,證明Wnt信号對于2MYCP培養基中mTBLCs的快速擴增至關重要,但它并不參與維持mTBLCs的全能性。
圖2. Wnt信号的激活促進了mTBLCs的快速擴增
2. mTBLCs具有獨特的表觀基因組特征,這些特征有助于其全能性維持和快速自我更新。通過ATAC-seq和CUT&Tag分析,發現mTBLCs的啟動子區域(TSS)H3K27me3和H3K9me3整體水平下降,而H3K4me3、H3K27ac和RNA Pol II标記整體水平未發生顯著變化,其表觀特征與早期胚胎的初期胚胎細胞(如2細胞階段)相似。此外,mTBLCs具有比PSCs更多的寬的H3K4me3域 (broad domain),以及更少的二價修飾基因(bivalent gene),且MERVL轉座子在mTBLCs中具有顯著的H3K4me3标記。Wnt信号通路的激活進一步增強了與細胞周期和增殖相關基因的H3K4me3富集,從而促進了mTBLCs的快速增殖。
圖3. mTBLCs具有類似早期卵裂球的特定表觀特征
3.本研究進一步評估了mTBLCs在體内外的分化潛力。在嵌合體實驗中,通過單細胞數據,捕獲到了EGFP标記的mTBLCs生成的13種細胞,其中包括7個胚外譜系和6個胚内譜系,證明了其在嵌合小鼠中的雙向發育潛能。此外,mTBLCs通過類胚體(EBs)和畸胎瘤實驗也都展示出了胚内外雙向分化潛能,産生了包括神經、心髒和腎髒等三胚層來源的細胞,也激活了包括經典滋養層标志基因,展示其能夠生成胚外滋養層樣譜系。總體而言,mTBLCs具有強大的雙向發育潛力,能夠分化為各種胚内外譜系,成為評估全能幹細胞發育潛力的重要工具。
圖4. mTBLCs具有強大的胚内外雙向分化潛能
4.本研究利用mTBLCs建立了一個模拟胚胎着床前發育的體外分化模型,以克服現有體外分化系統的挑戰。在基礎分化培養基中培養mTBLCs約3-4天後,細胞形态發生顯著變化,形成了胚胎幹細胞(ESC)、胚外内胚層幹細胞(XEN)和滋養層幹細胞(TSC)樣的克隆。RNA-seq分析顯示,mTBLCs在分化過程中激活了不同發育階段的基因,經曆了從早期初級基因組激活(minor ZGA)到主要基因激活(major ZGA)的轉變。免疫組化驗證了mTBLCs能夠分化為上胚層(EPI)、胚外滋養層(TE)和原始内胚層(PrE)等譜系。單細胞RNA測序揭示,mTBLCs在分化過程中産生了涵蓋2細胞、4細胞、8細胞及囊胚階段的多種細胞類型,拟時間分析顯示mTBLCs經曆了兩次命運決定,首次産生TE樣細胞和ICM/EPI樣細胞,随後ICM/EPI樣細胞分化産生了PrE樣細胞。
研究進一步發現,在自發分化過程中,mTBLCs 還産生了Zscan4+ 和 Zscan4- 兩類基因組激活樣細胞(ZLCs)。拟時間分析表明,隻有Zscan4- ZLCs 能夠成功分化為 EPI、PrE 和 TE 三大譜系。因此,本研究提出,主要的 ZGA調控網絡可能至少可以分為由 Zscan4 表達标記的兩個獨立部分。同時,Zscan4 的表達可能并不是進一步幹細胞命運決定所必需的。這一觀察結果也與人類 TBLC 的自發分化過程一緻,在這一過程中,經典的 ZGA 标志基因(如 ZSCAN4/5A、DUXA/B 和 TPRX1 等)完全沒有被誘導表達(Li et al., 2024)。這些發現不僅進一步證實了 mTBLCs 的内在全能性,也為探索哺乳動物胚胎發育過程中的共性機制提供了新視角。
圖5. mTBLCs自由分化體系模拟着床前胚胎發育
5. 此外,本研究發現,在沒有任何外源性信号幹預的情況下,單個mTBLC能夠經曆擴增、極化和壓實過程,最終高效率的形成結構完整的類囊胚(blastoid)。這一類囊胚結構不僅包含内細胞團、原始内胚層和滋養外胚層等胚胎樣細胞,且未見異常中間狀态的細胞,mTBLC來源的囊胚在轉錄組上與體内囊胚更為接近,三個譜系的特定标志物富集。并且類囊胚可以在體外繼續培養,發育成類似卵圓柱的後植入階段結構。也可以将類囊胚移植到假孕小鼠中,其成功植入并形成卵圓柱樣着床後胚胎結構。
圖6. mTBLCs生成類囊胚并進一步發育成着床後卵圓柱樣胚胎
綜上,本研究首次建立了基于 mTBLC 的自發分化和胚胎樣結構形成系統,成功模拟了胚胎早期發育的多個關鍵環節。尤其是在細胞命運決定和全能性研究領域,這一系統為理解早期胚胎發育中的細胞命運轉變提供了新的視角。此外,該研究還為胚胎發育模型的應用開辟了新的可能性,未來基于這一系統,科學家們有望深入研究胚胎發育異常的分子機制,探索病理過程,甚至為解決不孕不育等生育醫學問題提供全新解決方案。
杜鵬為該論文的通訊作者。beat365官方网站博士後彭冰、北京大學前沿交叉學科研究院博士研究生王清儀、beat365博士研究生張飛翔為本文的并列第一作者。beat365官方网站博士後申輝參與了部分工作。該項工作得到了北京高等學校卓越青年科學家計劃、北京市自然科學基金、國家自然科學基金、國家重點研發計劃基金的支持。
參考文獻
Li, S., Yang, M., Shen, H., Ding, L., Lyu, X., Lin, K., Ong, J., and Du, P. (2024). Capturing totipotency in human cells through spliceosomal repression. Cell 187, 3284-3302.e23. https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.05.010.
Shen, H., Yang, M., Li, S., Zhang, J., Peng, B., Wang, C., Chang, Z., Ong, J., and Du, P. (2021). Mouse totipotent stem cells captured and maintained through spliceosomal repression. Cell https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.04.020.
原文鍊接:https://www.cell.com/cell-stem-cell/abstract/S1934-5909(24)00446-6