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陶樂天

郵  箱: taolt (AT) mail.cbi.pku.edu.cn

職  稱:教授

辦公室電話:62752438

辦公室地址:北京市海澱區頤和園路5号,北京大學,王克桢樓,100871

所屬實驗室:陶樂天實驗室

實驗室電話:62752438

實驗室地址:北京市海澱區頤和園路5号,北京大學,王克桢樓,100871

  • 個人簡介
  • 科研領域
  • 代表性論文
  • 實驗室簡介

教育經曆:

1990 - 1995 , 理學博士 , 物理 , The University of Chicago
1986 - 1990 , 理學學士 , 物理 , Harvard University

工作經曆:

2004 - 2007 , 助理教授 , 新澤西理工大學

榮譽獎勵:

北京大學生命科學院鄭昌學獎教金,2017
北京大學教學優秀獎,2014
北京大學東寶獎教金,2012

執教課程:

生物數學建模 , 教授 , 2013 春 - 2018 春

      定量生物中心網站:
http://cqb.pku.edu.cn/kxdw/zxjs/tlt/253415.shtml
1. Xiao, Z., Wang, B., Sornborger, A.T.*, and Tao, L.*, `Mutual information and information gating in synfire chains,` Entropy (2018)
2. Xiao, Z., Zhang, J.W., Sornborger, A.T.*, and Tao, L.*, `Cusps enable line attractors for neural computation,` Phys. Rev. E. (2017)
3. Zhao, M. et al, `Segmentation and classification of two-channel C. elegans nucleus-labeled fluorescence images,` BMC Bioinformatics (2017)
4. Shao, Y., Sornborger, A.T.*, and Tao, L.*, “A pulse-gated, predictive neural circuit,” 2016 50th Asilomar Conference on Signals, Systems and Computers (2017)
5. Wang, Z., Sornborger, A.T. *, and Tao, L.*, “Graded, dynamically routable information processing with synfire-gated synfire chains,” PLoS Comput.Biol. 12(6): e1004979 (2016)
6. Sornborger, A.T.*; Wang, Z.; Tao, L.* “A mechanism for graded, dynamically routable current propagation in pulse-gated synfire chains and implications for information coding,” J. Comput. Neurosci. 39, 181-195 (2015)
7. Wang, C. and Tao, L.* “Dimensional reduction of a V1 ring model with simple and complex cells,” J. Comput. Neurosci. 37, 481-492 (2014)
8. Zheng, C. Yu, Z., Zhou, Y., Tao, L., Pang, Y., Chen, T., Zhang X. Qiu, H., Zhou, H., Chen, Z. and Huang Y., “Live cell imaging analysis of the epigenetic regulation of the human endothelial cell migration at single cell resolution,” Lab on a Chip, 32, 3063-3072 (2012)
9. Tao, L.*, Praissman, J., and Sornborger, A.T.*, “Improved dimensionally-reduced visual cortical network using stochastic noise modeling,” J. Comput. Neurosci., 32, 367-376 (2012)
10. Cai, D., Tao, L., Shkarayev, M.S., Rangan, A.V., McLaughlin, D.W., and Kovacic, G., “The role of fluctuations in coarse-grained descriptions of neuronal networks,” Comm. Math. Sci. 10, 307-354 (2012)
11. Tao, L.*, Lauderdale, J.D.* and Sornborger, A.T.*, “Mapping functional connectivity between neuronal ensembles with larval zebrafish transgenic for a ratiometric calcium indicator,” Frontiers in Neural Circuits 5, 2 (2011)
12. Carceras, M.J., Carrillo, J.A., and Tao, L., “A numerical solver for a nonlinear Fokker-Planck equation representation of neuronal network dynamics,” J. Comput. Phys. 230, 1084 (2011)
13. Tao, L.* and Sornborger, A.T.* “Dimensionally-reduced visual cortical network model predicts network response and connects system- and cellular-level descriptions,” J. Comput. Neurosci. 28, 91-106 (2010)
14. Kovacic, G., Tao, L., Rangan, A.V., and Cai, D., “Fokker-Planck description of conductance-based integrate-and-fire neuronal networks,” Phys. Rev. E 80, 021904 (2009)
主要的研究方向在于運用數學和大規模科學計算的方法去模拟、數值仿真、分析神經生物學中神經元網絡的動力學特性,通過數學分析了解哺乳動物皮層的生物功能是如何在神經元網絡各組分之間的相互作用中産生的。在神經生物學領域中最有意義的貢獻是揭示了神經元網絡動力學和網絡結構之間的可能聯系,而此聯系已有神經生理學上的實驗證據。并且通過模拟哺乳動物視皮層的大規模神經元網絡,利用數學方法找到了一個可能的分岔結構确定了一個視皮層動力學上的運行點,從而發現了哺乳動物視覺朝向選擇性的一個新機制。回國之後,課題組已經 (1) 利用數據時空分解方法研究大規模神經元網絡的動力學性質并進行數據驅動式降維; (2) 應用數學降維方法,開拓分析光學成像數據的技術,發展預測神經元功能網絡和功能連通性(functional connectivity)的算法,(3) 開展同時具有高空間分辨率和高時間分辨率的光學成像技術,研發線蟲行為及其神經環路同步成像的光學成像系統。

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