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伊成器

郵  箱: chengqi.yi (AT) pku.edu.cn

職  稱:教授

辦公室電話:62752895

辦公室地址:北京市海澱區頤和園路5号,北京大學,金光生命科學大樓,100871

所屬實驗室:伊成器實驗室

實驗室電話:62752895

實驗室地址:北京市海澱區頤和園路5号,北京大學,金光生命科學大樓,100871

實驗室主頁

http://yilab.org.cn

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  • 個人簡介
  • 科研領域
  • 代表性論文
  • 實驗室簡介

教育經曆:

2005 – 2010, 理學博士,芝加哥大學化學系
2001 – 2005, 理學學士,中國科學技術大學化學系


工作經曆:

2019- 至今,正教授,beat365官方网站
2014 - 至今,研究員(雙聘),北京大學化學與分子工程學院
2013 - 至今,研究員,北京大學合成與功能生物分子中心
2012 - 至今,研究員,北大清華生命聯合中心
2017 - 2018,長聘副教授,beat365官方网站
2012 - 2017,助理教授,beat365官方网站
2010 – 2011,博士後,芝加哥大學生物化學與分子生物學系

榮譽獎勵:

科學探索獎(醫學科學),2024
第十八屆中國青年科技獎,2024
樹蘭醫學青年獎,2024
第八屆中國化學會-英國皇家學會青年化學獎,2022
茅以升北京青年科技獎,2022
中源協和生命醫學獎創新突破獎,2022
國家自然科學基金委傑出青年科學基金項目,2018
科技部中青年科技創新領軍人才,2018
OKeanos-CAPA Young Investigator Award,2018
Bayer Investigator Award at PKU,2018
中國化學會化學生物學獎突出貢獻獎(35周歲以下),2018
第十六屆霍英東青年教師基金,2018
第十屆“藥明康德生命化學研究獎”學者獎,2016
中國化學會青年化學獎,2016
國家自然科學基金委優秀青年科學基金項目,2015
IUPAC Prize for Young Chemists, 2011

學術任職:

2017 - present, the Chinese Cell Biology Society
2013 – present, the RNA society
2013 – present, the Chinese Society of Biochemistry and Molecular Biology
2012 – present, the Chinese Crystallographic Society
2012 – present, the Chinese Chemical Society
        
    實驗室緻力于RNA/DNA修飾的生物學通路、功能和機制研究以及基因編輯新方法的開發。為了實現這一目标,我們綜合運用包括化學生物學、表觀遺傳學、基因編輯、單細胞組學和基因組學等多學科手段,旨在揭示核酸表觀遺傳修飾的新穎功能和調控機制。
1. RNA修飾和表觀轉錄組學
    幾十年的研究已經鑒定了100多種轉錄後修飾。研究人員之前認為,一旦RNA修飾産生,這些共價修飾都是穩定存在、不可逆轉的。然而,最近關于6-甲基腺嘌呤(m6A)的一系列研究證明,RNA甲基化也是動态可逆的,并且在基因表達調控中起到重要作用。因此,“表觀轉錄組學”也随之興起。
除了m6A,轉錄組上還存在其它表觀遺傳修飾。我們課題組最近的研究發現,多種之前認為隻在非編碼RNA上存在的轉錄後修飾,即假尿嘧啶(Ψ)和1-甲基腺嘌呤(m1A),也廣泛存在于哺乳動物的mRNA當中。我們的研究表明這些轉錄後修飾在轉錄組中廣泛存在,受多種外界刺激的動态調控,并且對于m1A來說,可以被潛在的“eraser”消碼器蛋白去甲基化。然而,mRNA上m1A和Ψ修飾的生物學功能還尚不清楚。此外,我們最近鑒定了mRNA上的動态、可逆修飾m6Am。我們希望利用課題組已經開發的新穎表觀轉錄組測序技術,來闡釋這些RNA修飾在生理及病理條件下的功能和調控機制,從而在表觀轉錄組學這個新興起的學科中發現一片“新大陸”。

2. 基因編輯
    基因編輯作為新興的颠覆式生物技術,已經在生物醫藥、農業、能源和生物安全等方面展現了巨大的潛力。基于我們在化學生物學、分子生物學和高通量測序等方面的特長,本課題組也評價現有的基因編輯工具,并發展更為精準、強大、便捷的基因編輯新技術。

3. DNA修飾和表觀基因組學
    哺乳動物基因組中,具有5-甲基胞嘧啶(5mC)、5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)、5-醛基胞嘧啶(5fC)和5-羧基胞嘧啶(5caC)等多種表觀基因組修飾。本實驗室開發了多個單堿基、單細胞水平上表觀基因組的組學檢測技術,未來将應用于單細胞測序和臨床研究,以期鑒定疾病的生物标志物。此外,我們也關注染色質可及性的組學檢測技術。



1. Luo N, Huang Q, Dong L, Liu W, Song J, Sun H, Wu H, Gao Y, Yi C. Near-cognate tRNAs increase the efficiency and precision of pseudouridine-mediated readthrough of premature termination codons. Nat Biotechnol. 2025, 43(1):114-123.
2. Bai D, Zhang X, Xiang H, Guo Z, Zhu C, Yi C. Simultaneous single-cell analysis of 5mC and 5hmC with SIMPLE-seq. Nat Biotechnol. 2025, 43(1):85-96.
Song J, Dong L, Sun H, Luo N, Huang Q, Li K, Shen X, Jiang Z, Lv Z, Peng L, Zhang M, Wang K, Liu K, Hong J, Yi C. CRISPR-free, programmable RNA pseudouridylation to suppress premature termination codons. Mol Cell. 2023, 83, 139-155.
3. Sun H, Li K, Liu C, Yi C. Regulation and functions of non-m6A mRNA modifications. Nat Rev Mol Cell Biol. 2023, 24(10):714-731.
4. Liu C, Sun H, Yi Y, Shen W, Li K, Xiao Y, Li F, Li Y, Hou Y, Lu B, Liu W, Meng H, Peng J, Yi C *, Wang J.* Absolute quantification of single-base m6A methylation in the mammalian transcriptome using GLORI. Nat Biotechnol. 2023,41,355-366.
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10. Cui Q, Yin K, Zhang X, Ye P, Chen X, Chao J, Meng H, Wei J, Roeth D, Li L, Qin Y, Sun G, Zhang M, Klein J, Huynhle M, Wang C, Zhang L, Badie B, Kalkum M, He C, Yi C* and Shi Y*. Targeting PUS7 suppresses tRNA pseudouridylation and glioblastoma tumorigenesis. Nat Cancer.2021; 2:932–949.
11. Liu J, Li K, Cai J, Zhang M, Zhang X, Xiong X, Meng H, Xu X, Huang Z, Peng J. Fan J*, YI C*. Landscape and Regulation of m6A and m6Am Methylome across Human and Mouse Tissues. Mol Cell. 2020; 77:426-440.
12. Song J, Zhuang Y, Zhu C, Meng H, Lu B, Xie B, Peng J, Li M*, Yi C*. Differential roles of human PUS10 in miRNA processing and tRNA pseudouridylation. Nat Chem Biol. 2020; 16: 160-169.

實驗室緻力于RNA/DNA修飾的新生物學通路、新功能和新機制研究以及基因編輯新方法的開發。我們綜合運用包括化學生物學、表觀遺傳學、RNA修飾、基因編輯、單細胞組和基因組學等多學科手段,尤其關注RNA生物學在人類疾病診斷與治療當中的應用。

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