個人介紹:

杜鵬，beat365官方网站/北大-清華生命聯合中心研究員、博雅特聘教授。2012年于北京大學獲得博士學位，後進入哈佛大學醫學院/波士頓兒童醫院從事博士後研究。2018年起任beat365官方网站/北大-清華生命科學聯合中心研究員。其課題組主要從事幹細胞和轉化醫學中RNA生物學相關研究，同時緻力于在動物細胞中重組植物或微生物中特異的RNA調控通路，并研究其潛在的轉化醫學的應用價值。以獨立及共同通訊作者，分别在Cell, Nature，Cell Stem Cell等雜志上發表多篇論文。并獲得國家傑出青年科學基金，海外高層次人才項目（青年），基金委原創探索計劃項目，科技部國家重點研發計劃及颠覆性技術創新項目的支持和資助；現任中國細胞生物學會發育生物學分會副會長，幹細胞生物學分會委員等；

教育經曆:

2006.09-2012.07 博士，beat365官方网站；
2002.09-2006.07 學士，山東師範大學beat365

工作經曆:

2023年12月-至今，研究員，北京大學核糖核酸北京研究中心；
2018年09月-至今，研究員，北大-清華生命科學聯合中心；
2018年09月-至今，助理教授/副教授/教授，beat365官方网站；
2012年09月-2018年09月，博士後，哈佛大學醫學院/波士頓兒童醫院；
2010年09月-2012年04月，訪問學者，加州大學河濱分校

榮譽獎勵:

中國青年科技獎，2024
談家桢生命科學創新獎，2024
中國細胞生物學學會青年科學家獎, 2024
亞洲青年科學家獎，2023
鐘南山青年科技獎，2023
中源協和生命醫學創新突破獎，2022
顧孝誠講座獎，2022
優秀論文指導教師獎，2022
中國幹細胞生物學學會卓越青年研究員獎，2021
勃林格殷格翰青年研究員獎，2021
東寶獎教金，2021;
拜耳學者獎, 2019;
億方學者, 2019;

學術任職:

2023年-至今，中國細胞生物學會發育生物學分會副會長
2023年-至今，中國細胞生物學會幹細胞生物學分會委員
2023年-至今，北京細胞生物學會委員
2022年-至今，北京大學教育部細胞增殖與分化重點實驗室副主任

雜志任職:

2023年-至今，青年編委，中國科學：生命科學（SCLS）

執教課程:

生命科學原理與前沿（本），秋季
高級遺傳學（研、CLS），秋季
發育生物學（研、PTN），春季

      本課題組的研究集中在RNA生物學與幹細胞生物學。我們綜合運用傳統的生物化學，分子生物學，結合高通量測序，基因組學，生物信息學等手段來分析和鑒定未知的RNA調控通路，研究相關RNA調控通路在胚胎幹細胞的分化命運決定和早期胚胎發育中的功能。同時，我們緻力于在動物細胞中重組植物或微生物中特異的RNA調控通路，并分析其潛在的對于基礎科學研究和轉化醫學研究中的價值。
主要研究課題：
1, 鑒定未知的RNA調控元件及分析其對應的調控機制。
2, 研究RNA調控如何決定胚胎幹細胞全能性及多能性狀态的轉化及分化命運。
3, 哺乳動物細胞中植物或微生物RNA調控通路的重建及其潛在應用。

1. Bing Peng, Qingyi Wang, Feixiang Zhang, Hui Shen, Peng Du* (2025) Mouse totipotent blastomere-like cells model embryogenesis from zygotic genome activation to post implantation. Cell Stem Cell. 10.1016/j.stem.2024.12.006
2. Shiyu Li, Min Yang, Hui Shen, Li Ding, Xuehui Lyu, Kexin Lin, Jennie Ong, and Peng Du* (2024). Capturing totipotency in human cells through spliceosomal repression. Cell. 187(13):3284-3302. e23.
3. Xuehui Lyu, Yingzi Cui, Yinfei Kong, Min Yang, Hui Shen, Shuyun Liao, Shiyu Li, Chenrui An, Haoyi Wang, Zhe Zhang, Jennie Ong, Yan Li, Peng Du* (2024). A transient transcriptional activation governs unpolarized-to-polarized morphogenesis during embryo implantation. Molecular Cell. S1097-2765(24)00483-0.
4. Peng Du* and Jun Wu* (2024). Hallmarks of totipotent and pluripotent stem cell states. Cell Stem Cell. 31:312-333.
5. Min Yang, Jennie Ong, Fanju Meng, Feixiang Zhang, Hui Shen, Kerstin Kitt, Tengfei Liu, Wei Tao and Peng Du* (2023). Spatiotemporal insight of early pregnancy governed by immune-featured stromal cells. Cell.186:4271-4288.
6. Yanxin Li, Zhongqiu Li, Changliang Wang, Min Yang, Ziqing He, Feiyang Wang, Yuehong Zhang, Rong Li, Yunxia Gong, Binhong Wang, Baoguang Fan, Chunyue Wang, Lei Chen, Hong Li, Peifu Shi, Nana Wang, Zhifeng Wei, Yan-Ling Wang, Lei Jin*, Peng Du*, Ji Dong*, and Jianwei Jiao* (2023). Spatiotemporal transcriptome atlas reveals the regional specification of the developing human brain. Cell.186:5892-5909.
7. Jianfeng Fu, Siru Zhou, Huilin Xu, Liming Liao, Hui Shen, Peng Du, and Xiaofeng Zheng* (2023). ATM–ESCO2–SMC3 axis promotes 53BP1 recruitment in response to DNA damage and safeguards genome integrity by stabilizing cohesin complex. Nucleic acids research. 51:7376-7391.
8. Yingzi Cui, Ye Qi, Li Ding, Shuangjin Ding, Zonglin Han, Yangming Wang* and Peng Du* (2023). miRNA dosage control in development and human disease. Trends in Cell Biology.34(1):31-47.
9. Ye Qi, Li Ding, Siwen Zhang, Shengze Yao, Jennie Ong, Yi Li, Hong Wu, and Peng Du* (2022). A plant immune protein enables broad antitumor response by rescuing microRNA deficiency in cancers. Cell.185:1888-1904.
10. Yanxin Li, Zhongqiu Li, Min Yang, Feiyang Wang, Yuehong Zhang, Rong Li, Qian Li, Yunxia Gong, Binhong Wang, Baoguang Fan, Chunyue Wang, Lei Chen, Hong Li, Jennie Ong, Zhaoqian Teng, Lei Jin*, Yan-Ling Wang*, Peng Du* and Jianwei Jiao* (2022). Decoding the temporal and regional specification of microglia in the developing human brain. Cell Stem Cell. 29: 620-634.
11. Hui Shen, Min Yang, Shiyu Li, Jing Zhang, Bing Peng, Chunhui Wang, Zai Chang, Jennie Ong, and Peng Du* (2021). Mouse totipotent stem cells captured and maintained through spliceosomal repression. Cell. 184:2843-2859.
12. Yingzi Cui, Xuehui Lyu, Li Ding, Lan Ke, Dechang Yang, Mehdi Pirouz, Ye Qi, Jennie Ong, Ge Gao, Peng Du*, and Richard Gregory* (2021). Global miRNA dosage control of embryonic germ layer specification. Nature.593:602-606.
13. Bingqing Xie, Da Sun, Yuanyuan Du, Jun Jia, Shicheng Sun, Jun Xu, Yifang Liu, Chengang Xiang, Sitong Chen, Huangfan Xie, Qiming Wang, Guangya Li, Xuehui Lyu, Hui Shen, Shiyu Li, Min Wu, Xiaonan Zhang, Yue Pu, Kuanhui Xiang, Weifeng Lai, Peng Du, Zhenghong Yuan, Cheng Li, Yan Shi, Shichun Lu, Hongkui Deng (2019). A two-step lineage reprogramming strategy to generate functionally competent human hepatocytes from fibroblasts. Cell research.29: 696-710.

14. Before Independent
15. Junho Choe, Shuibin Lin, Wencai Zhang, Qi Liu, Longfei Wang, Julia Ramirez-Moya, Peng Du, Wantae Kim, Shaojun Tang, Piotr Sliz, Pilar Santisteban, Rani E George, William G Richards, Kwok-Kin Wong, Nicolas Locker, Frank J Slack, Richard I Gregory (2018). mRNA circularization by METTL3-eIF3h enhances translation and promotes oncogenesis. Nature.561:556-560.
16. Hee Ho Park, Robinson Triboulet, Martin Bentler, Swaroopa Guda, Peng Du, Haiming Xu, Richard I Gregory, Christian Brendel, David A Williams (2018). Drosha knockout leads to enhancement of viral titers for vectors encoding miRNA-adapted shRNAs. Molecular Therapy.12:591-599.
17. Peng Du, Mehdi Pirouz, Jiho Choi, Aaron J Huebner, Kendell Clement, Alexander Meissner, Konrad Hochedlinger, Richard I Gregory (2018). An intermediate pluripotent state controlled by microRNAs is required for the naive-to-primed stem cell transition. Cell Stem Cell.22:851-864.
18. Mehdi Pirouz, Peng Du, Marzia Munafò, Richard I Gregory (2016). Dis3l2-mediated decay is a quality control pathway for noncoding RNAs. Cell Reports. 16:1861-73.
19. Shuibin Lin, Junho Choe, Peng Du, Robinson Triboulet, Richard I Gregory (2016). METTL3 promotes translation in human cancer cells. Molecular Cell. 62:335-45.
20. Peng Du, Longfei Wang, Piotr Sliz, Richard I Gregory (2015). A biogenesis step upstream of microprocessor controls miR-17∼92 expression. Cell. 162:885-99.
21. Swaroopa Guda, Christian Brendel, Raffaele Renella, Peng Du, Daniel E Bauer, Matthew C Canver, Jennifer K Grenier, Andrew W Grimson, Sophia C Kamran, James Thornton, Helen de Boer, David E Root, Michael D Milsom, Stuart H Orkin, Richard I Gregory, David A Williams (2015). miRNA-embedded shRNAs for lineage-specific BCL11A knockdown and hemoglobin F induction. Molecular Therapy. 10.1038.
22. James E Thornton, Peng Du, Lili Jing, Ljiljana Sjekloca, Shuibin Lin, Elena Grossi, Piotr Sliz, Leonard I Zon, Richard I Gregory (2014). Selective microRNA uridylation by Zcchc6 (TUT7) and Zcchc11 (TUT4). Nucleic Acids Res. 42:11777-91.
23. Mengji Cao#, Peng Du#, Xianbing Wang, Yun-Qi Yu, Yan-Hong Qiu, Wanxiang Li, Amit Gal-On, Changyong Zhou, Yi Li, Shou-Wei Ding (2014). Virus infection triggers widespread silencing of host genes by a distinct class of endogenous siRNAs in Arabidopsis. PNAS.111:14613-8.
24. Peng Du#, Jianguo Wu#, Jiayao Zhang, Shuqi Zhao, Hong Zheng, Ge Gao, Liping Wei, Yi Li (2011). Viral infection induces expression of novel phased microRNAs from conserved cellular microRNA precursors. PLoS Pathogens. 7:e1002176.

我們的研究集中于幹細胞與轉化醫學中的RNA生物學。

在幹細胞研究方面，實驗室最近的研究通過對于剪接體（splicesoeme）的抑制，實現了迄今為止分化潛能最高的人類和小鼠的全能性胚胎幹細胞的捕獲和培養 (Cell, 2021; Cell, 2024)。在此基礎上，我們将進一步對該培養條件進行優化，以期最終獲得不同物種來源的全能性幹細胞的體外培養。繼而全能性幹細胞為起始細胞，探索其分化到不同種類的功能細胞及類器官的分化體系，并進行動物個體的從頭合成和重構，從而最終獲得可應用于再生醫學的高質量細胞和器官。

實驗室也利用基礎的生物化學和分子生物學的手段鑒定和發現新型的RNA調控通路。實驗室最新的研究發現了一種通過基因轉錄起始事件介導的的微小RNA（microRNA）的整體劑量調控機制，以及該機制在早期胚胎發育三胚層命運決定中的關鍵作用 (Nature, 2021)。未來我們繼續緻力于發現和鑒定決定細胞分化命運及腫瘤發生過程中的核心RNA介導的調控通路，并解析其生理學功能。

我們在嘗試利用已知相關知識進行跨物種基因工程應用的相關研究。比如我們最近利用一種植物特異免疫蛋白RDR，實現了對于腫瘤細胞中有缺陷的miRNA的特異編輯和修複，恢複了miRNA對于腫瘤細胞增值的廣譜抑制，開發了腫瘤治療的新方案 (Cell, 2022)。

最後我們也廣泛利用單細胞轉錄組及空間轉錄組等高通量測序技術，解析早期胚胎發育過程及兒童腫瘤發生過程中發育及腫瘤微環境的建立及穩态維持，并試圖找到決定早期胚胎發育及疾病發生過程的決定的關鍵環境因子及事件（Cell Stem Cell, 2022; Cell, 2023a; Cell, 2023b)。

實驗室電話010-62750759