個人介紹:

長期以斑馬魚為主要模式從事脊椎動物心血管等組織器官發育與再生以及功能基因組學研究。創建并優化了一系列以TALEN和CRISPR/Cas系統為基礎的基因組靶向突變與精确修飾技術，近五年通過設計正-負雙元件供體（PoNe）和正-反雙元件供體（Bi-FoRe），在斑馬魚中實現了快速、高效、同步構建兼具條件性基因敲除/拯救和活體基因型标記效果的雙功能基因敲入技術；在單細胞水平解析了斑馬魚胰島發育與心髒再生過程，鑒定出心髒再生特異調控因子Angpt4。迄今在Nature Biotechnology、Nature Methods、PNAS、eLife等學術期刊發表SCI論文90餘篇，申請發明專利6項，已授權4項。曾獲國家自然科學二等獎，入選教育部“新世紀優秀人才支持計劃”。現任Genetics、Journal of Genetics and Genomics和Zebrafish期刊編委，中國實驗動物學會水生實驗動物專業委員會副主任委員、中國動物學會斑馬魚分會委員會常務委員、中國遺傳學會基因組編輯分會委員、中國遺傳學會教育教學委員會委員和北京水産學會常務理事。

教育經曆:

1992 - 1995 , 理學博士 , 細胞生物學 , beat365官方网站
1989 - 1992 , 理學碩士 , 細胞生物學 , beat365官方网站
1985 - 1989 , 理學學士 , 細胞生物學 , 北京大學生物學系

工作經曆:

2004年 8月 - 至今, 教授, beat365官方网站
2004年12月 - 2005年8月, 訪問學者, 美國加州大學洛杉矶分校，分子、細胞與發育生物學系
1997年 9月 - 2002年7月, 博士後, 瑞士蘇黎世大學，分子生物學研究所
1995年 7月 - 2004年7月, 副教授, beat365官方网站
1994年 8月 - 1995年2月, 訪問學者, 美國威斯康星大學麥迪遜分校，醫學院生物分子化學系

社會服務工作:

2024年 - 至今，中國人民大學附屬中學通州校區崇德書院，導師及名譽院長

榮譽獎勵:

beat365官方网站“鄭昌學教學優秀獎”，2021
楊芙清王陽元院士優秀教學科研獎，2018
北京大學教學優秀獎，2013
北京大學教學優秀獎，2009
北京大學東寶獎教金，2007
教育部“新世紀優秀人才支持計劃”，2004
教育部“優秀青年教師資助計劃”，2004
北京大學第四屆青年教師教學基本功和現代教育技術應用演示競賽一等獎，2004
國家自然科學獎二等獎，2001
中國高校科學技術獎一等獎，2001

學術任職:

2024年 - 至今，中國實驗動物學會第五屆水生實驗動物專業委員會，副主任委員
2024年 - 至今，中國遺傳學會第十一屆理事會教育教學委員會，委員
2024年 - 至今，西南聯合研究生院第三屆研究生導師
2022年 - 至今，中國生物工程學會動物生物技術專業委員會，委員
2021年 - 至今，中國動物學會斑馬魚分會第二屆委員會，常務委員
2021年 - 至今，北京水産學會理事會，常務理事
2019年 - 至今，中國遺傳學會基因組編輯分會，委員

雜志任職:

2024年 - 至今，《Genetics》編委
2020年 - 至今，《Journal of Genetics and Genomics》編委
2019年 - 至今，《Zebrafish》編委

評審任職:

2004年 - 至今，國家自然科學基金，評審專家

雜志編輯:

2024年 - 至今，《Genetics》編委
2020年 - 至今，《Journal of Genetics and Genomics》編委
2019年 - 至今，《Zebrafish》編委

教材編撰:

戴灼華、王亞馥主編，丁毅、張博副主編，《遺傳學》（第3版），“十二五”普通高等教育本科國家級規劃教材；高等教育出版社，北京，2016年
佟向軍、張博，《遺傳學學習指導與題解》，戴灼華審校，高等教育出版社，北京，2009年
參編《遺傳學實驗指導》第1、2版（張文霞、戴灼華主編，高等教育出版社，2007年，2019年）
參編《分子細胞生物學》第1、2、3版（普通高等教育“十一五”國家級規劃教材；全國優秀教材二等獎；陳晔光、張傳茂、陳佺主編，高等教育出版社，北京，2006年，2011年，2019年）
參編《細胞生物學》第2版（面向21世紀課程教材；翟中和、王喜忠、丁明孝主編，高等教育出版社，2000年）

執教課程:

遺傳學，主持人，北京大學本科生主幹基礎課, 2006-至今，秋季學期
PTN遺傳track，主講，2016-至今
PTN發育生物學，主講，2020-至今
細胞遺傳發育前沿，主講，2020-至今
遺傳學與發育生物學進展, 主持人, 北京大學, 2010年

      （1）在斑馬魚（zebrafish，學名Danio rerio）中開發并完善以CRISPR/Cas系統為基礎的基因組靶向編輯技術；
（2）以斑馬魚為主要模式動物，綜合運用單細胞測序、基因組編輯、譜系示蹤等手段，研究心髒等組織器官發育與再生的遺傳基礎及其基因表達調控機制，建立人類疾病的斑馬魚模型并研究發病機制。

1. Hu, Y., Luo, Z., Wang, M., Wu, Z., Liu, Y., Cheng, Z., Sun, Y., Xiong, J.-W., Tong, X., Zhu, Z. and Zhang, B. 2024. Prox1a promotes liver growth and differentiation by repressing cdx1b expression and intestinal fate transition in zebrafish. J. Genet. Genomics, 52 (1): 66-77.
2. Krueger, C. J., Dai, Z., Zhu, C. and Zhang, B., 2024, Heritable CRISPR mutagenesis of essential maternal effect genes as a simple tool for sustained population suppression of invasive species in a zebrafish model. Zebrafish. 21 (4): 279-286.
3. Wu, Z., Shi, Y., Cui, Y., Xing, X., Zhang, L., Liu, D., Zhang, Y., Dong, J., Jin, L., Pang, M., Xiao, R.-P., Zhu, Z., Xiong, J.-W., Tong, X., Zhang, Y., Wang, S., Tang, F. and Zhang, B., 2022, Single-cell analysis reveals an Angpt4-initiated EPDC-EC-CM cellular coordination cascade during heart regeneration. Protein Cell, 14 (5): 350-368.
4. Han, B., Zhang, Y., Zhou, Y., Zhang, B., Krueger, C. J., Bi, X., Zhu, Z., Tong, X. and Zhang, B., 2022, ErCas12a and T5exo-ErCas12a mediate simple and efficient genome editing in zebrafish. Biology, 11: 411.
5. Han, B., Zhang, Y., Bi, X., Zhou, Y., Krueger, C. J., Hu, X., Zhu, Z., Tong, X. and Zhang, B., 2021, Bi-FoRe: An efficient bidirectional knockin strategy to generate pairwise conditional alleles with fluorescent indicators. Protein Cell, 12 (1): 39-56. (Cover story)
6. Wang, Y., Ping, L., Luan, X., Chen, Y., Fan, X., Li, L., Liu, Y., Wang, P., Zhang, S., Zhang, B. and Chen, X., 2020, A mutation in VWA1, encoding von Willebrand factor A domain-containing protein 1, is associated with hemifacial microsomia. Front. Cell Dev. Biol., 8: 571004.
7. Li, W., Zhang, Y., Han, B., Li, L., Li, M., Lu, X., Chen, C., Lu, M., Zhang, Y., Jia, X., Zhu, Z., Tong, X. and Zhang, B., 2019, One-step efficient generation of dual-function conditional knockout and geno-tagging alleles in zebrafish. eLife, 8: e48081.
8. Lu, C.-J., Fan, X.-Y., Guo, Y.-F., Cheng, Z.-C., Dong, J., Chen, J.-Z., Li, L.-Y., Wang, M.-W., Wu, Z.-K., Wang, F., Tong, X.-J., Luo, L.-F., Tang, F.-C., Zhu Z.-Y. and Zhang, B., 2018, Single-cell analyses identify distinct and intermediate states of zebrafish pancreatic islet development. J. Mol. Cell Biol., 11 (6): 435–447.
9. Zhang, J., Wang, C., Shen, Y., Chen, N., Wang, L., Liang, L., Guo, T., Yin, X., Ma, Z., Zhang, B. and Yang, L., 2016, A mutation in ADIPOR1 causes nonsyndromic autosomal dominant retinitis pigmentosa. Human Genetics, 135 (12): 1375-1387.
10．Xiao, A. and Zhang, B., 2016, Generation of targeted genomic deletions through CRISPR/Cas system in zebrafish. Methods Mol. Biol., 1451: 65-79.
11. Huang, P., Xiao, A., Tong, X., Lin, S. and Zhang, B., 2016, Targeted Mutagenesis in Zebrafish by TALENs. Methods Mol. Biol., 1338: 191-206.
12. Liu, D., Wang, Z., Xiao, A., Zhang, Y., Li, W., Zu, Y., Yao, S., Lin, S. and Zhang, B., 2014, Efficient gene targeting in zebrafish mediated by a zebrafish-codon-optimized Cas9 and evaluation of off-targeting effect. J. Genet. Genomics, 41: 43-46.
13. Xiao, A., Cheng, Z., Kong, L., Zhu, Z., Lin, S., Gao G. and Zhang, B., 2014, CasOT: a genome-wide Cas9/gRNA off-target searching tool., Bioinformatics, 30 (8): 1180-1182.
14. Huang, P., Xiao, A., Tong, X., Zu, Y., Wang, Z. and Zhang, B., 2014, TALEN construction via Unit Assembly method and targeted genome modifications in zebrafish. Methods, 69 (1): 67-75.
15. Tong, X., Zu, Y., Li, Z., Li, W., Ying, L., Yang, J., Wang, X., He, S., Liu, D., Zhu, Z., Chen, J., Lin, S. and Zhang, B., 2014, Kctd10 regulates heart morphogenesis by repressing the transcriptional activity of Tbx5a in zebrafish. Nat. Commun., 5: 3153.
16. Zu, Y., Tong, X., Wang, Z., Liu, D., Pan, R., Li, Z., Hu, Y., Luo, Z., Huang, P., Wu, Q., Zhu, Z., Zhang, B., Lin, S., 2013, TALEN-mediated precise genome modification by homologous recombination in zebrafish. Nat. Methods, 10 (4): 329-331. (Cover story)
17. Xiao, A., Wu, Y., Yang, Z., Hu, Y., Wang, W., Zhang, Y., Kong, L., Gao, G., Zhu, Z., Lin, S. and Zhang, B., 2013a, EENdb: a database and knowledge base of ZFNs and TALENs for endonuclease engineering. Nucleic Acids Res., 41: D415-D422.
18. Xiao, A., Wang, Z., Hu, Y., Wu, Y., Luo, Z., Yang, Z., Zu, Y., Li, W., Huang, P., Tong, X., Zhu, Z., Lin, S. and Zhang, B., 2013b, Chromosomal deletions and inversions mediated by TALENs and CRISPR/Cas in zebrafish. Nucleic Acids Res., 41 (14): e141.
19. Wei, C., Liu, J., Yu, Z., Zhang, B., Gao, G. and Jiao, R., 2013, TALEN or Cas9 - rapid, efficient and specific choices for genome modifications. J. Genet. Genomics, 40 (6): 281-289. (Invited review)
20. Xia, Z., Tong, X., Liang, F., Zhang, Y., Kuok, C., Zhang, Y., Liu, X., Zhu, Z., Lin, S. and Zhang, B., 2013, Eif3ba regulates cranial neural crest development by modulating p53 in zebrafish. Dev. Biol., 381 (1): 83-96.
21. Tong, X., Xia, Z., Zu, Y., Telfer H., Hu, J., Yu, J., Liu, H., Zhang, Q., Sodmergen, Lin, S. and Zhang, B., 2013, Ngs (notochord granular surface) encodes a novel type of intermediate filament family protein essential for notochord maintenance in zebrafish. J. Biol. Chem., 288 (4): 2711-2720.
22. Jiang, L., Zhang, J., Wang, J.-J., Wang, L., Zhang, L., Li, G., Yang, X., Ma, X., Sun, X., Cai, J., Zhang, J., Huang, X., Yu,. M., Wang, X., Liu, F., Wu, C.-I, He, C., Zhang, B., Ci, W. and Liu, J., 2013, Sperm DNA methylome is inherited during zebrafish early embryogenesis. Cell, 153: 773-784.
23. Huang, P., Zhu, Z., Lin, S. and Zhang, B., 2012, Reverse genetic approaches in zebrafish. J. Genet. Genomics, 39 (9): 421-433. (Invited review)
24. Huang, P., Xu, L., Liang, W., Tam, C. I., Zhang, Y., Qi, F., Zhu, Z., Lin, S. and Zhang, B., 2012, Genomic deletion induced by Tol2 transposon excision in zebrafish. Nucleic Acids Res., 41 (2): e36.
25. Huang, P., Xiao, A., Zhou, M., Zhu, Z., Lin, S. and Zhang, B., 2011, Heritable gene targeting in zebrafish using customized TALENs. Nat. Biotechnol., 29 (8): 699-700.
26. Gao, W., Xu, L., Guan, R., Liu, X., Han, Y., Wu, Q., Xiao, Y., Qi, F., Zhu, Z., Lin, S. and Zhang, B., 2011, Wdr18 is required for Kupffer’s vesicle formation and regulation of body asymmetry in zebrafish. PLoS ONE, 6 (8): e23386.
27. Jiang, Z., Song, J., Qi, F., Xiao, A., An, X., Liu, N. A., Zhu, Z., Zhang, B. and Lin S., 2008, Exdpf is a key regulator of exocrine pancreas development controlled by retinoic acid and ptf1a in zebrafish. PLoS Biol., 6 (11): e293.
28. Wei, W., Wen, L., Huang, P., Zhang, Z., Chen, Y., Xiao, A., Huang, H., Zhu, Z., Zhang, B. and Lin, S, 2008, Gfi1.1 regulates hematopoietic lineage differentiation during zebrafish embryogenesis. Cell Res., 18: 677-685.
29. Wen, L., Wei, W., Gu, W., Huang, P., Ren, X., Zhang, Z., Zhu, Z., Lin, S. and Zhang, B., 2008, Visualization of monoaminergic neurons and neurotoxicity of MPTP in live transgenic zebrafish. Dev. Biol., 314 (1): 84-92.
30. Wang, D., Jao, L.-E., Zheng, N., Dolan, K., Ivey, J., Zonies, S., Wu, X., Wu, K., Yang, H., Meng, Q., Zhu, Z., Zhang, B., Lin, S. and Burgess, S. M., 2007, Efficient genome-wide mutagenesis of zebrafish genes by retroviral insertions. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 104 (30): 12428-12433.
31. Zhang B., Georgiev O., Hagmann M., Günes., Faller P., Vasák M. and Schaffner W, 2003, Activation of metal transcription factor-1 (MTF-1) by toxic heavy metals and H2O2 in vitro is modulated by metallothionein. Mol. Cell. Biol., 23(23): 8471-8485.
32. Zhang B., Egli D., Georgiev O. and Schaffner W., 2001, The Drosophila homolog of mammalian zinc finger factor MTF-1 activates transcription in response to heavy metals. Mol. Cell. Biol., 21(14): 4505-4514.

以斑馬魚（Danio rerio）為模式動物，開發并完善以CRISPR/Cas為基礎的基因組編輯技術，結合單細胞測序等技術，研究心血管、胰腺等組織器官發育與再生的遺傳基礎及其基因表達調控機制，建立人類疾病的斑馬魚模型并進行發病機制研究。