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Understanding Human Diseases through Tandem Repeats, Alternative Polyadenylation and Liquid Biopsy

日期: 2024-11-02

北京大學定量生物學中心/生命科學聯合中心

學術報告

題    目: Understanding Human Diseases through Tandem Repeats, Alternative Polyadenylation and Liquid Biopsy

報告人:  Wei Li (李蔚), Ph.D.

Grace B. Bell Endowed Chair and Professor of Bioinformatics, The University of California, Irvine

時  間: 11月8日(周五)10:00-11:00

地    點: 呂志和樓B101

主持人: 韓敬東 教授

摘要:

Tandem Repeat (TR) variations are underutilized in medical diagnostics despite their potential impact on human traits and diseases. We recently developed the TR-Atlas (Cell 2024), which includes data on 0.86 million TRs from 338,963 diverse individuals. Utilizing TR-gnomAD as a control, our analysis of undiagnosed patients has identified several TR variants potentially linked to disease phenotypes.  Additionally, our work on alternative polyadenylation (APA) has uncovered numerous APA-linked risk genes for complex diseases. Our advances in DNA methylation analysis have also led to multiple US patents and the development of a liquid biopsy technique for early detection of liver cancer, which is nearing FDA approval. Together, this talk will explore how these cutting-edge approaches are transforming our understanding of disease biology and driving the future of precision medicine.

報告人簡介:

李蔚博士是國際知名的生物信息學專家,美國加州大學(爾灣)醫學院生物信息講席教授,本科畢業于南京大學物理學院,獲得中國科學院生物物理研究所博士學位,并在哈佛大學醫學院Dana-Farber癌症研究中心進行博士後研究。李博士曾任華大基因生物信息室副主管,參與并主導多個中國早期基因組項目。在過去20年中,他在生物信息學算法、表觀遺傳學和大規模數據分析方面取得了突出成就,尤其是在利用大數據挖掘解釋複雜疾病如癌症、衰老、漸凍症等。他開發的MACS算法已成為CHIP-SEQ數據分析的标準工具,被引用超過16,000次。李教授的實驗室與多家國際一流實驗室和生物科技公司合作,緻力于發現新的緻病機理、疾病早期診斷生物标志物和開發新型RNA治療藥物。李蔚教授目前已發表200多篇研究論文。其中35篇通訊作者文章在Nature, Cell & Science以及其子刊發表。論文總引用超過7.4萬次(H-index 高達98)。李蔚教授過去的學生已經有11位在一流研究型大學(包含哈佛醫學院)獲得獨立PI的教授職位,3位獲得了中國國家海外優青頭銜。實驗室詳情參見:https://sites.uci.edu/weililab/